Trong Điệp Viên Nhí: Nhiệm Vụ Tối Mật (Phần 2), những đứa trẻ của Đội Đặc Nhiệm Tối Trọng phải đối mặt với thách thức mới khi phải chiến đấu trong học viện để ngăn chặn một tên gián điệp gian ác do Bộ Não Vàng cử đến. Nhiệm vụ của họ là bảo vệ huyết thanh Pinnoquinox quý giá khỏi sự xâm nhập của kẻ thù. Phim có sự tham gia của các diễn viên nổi tiếng như Ashley Bornancin, Carter Hastings, Caitlyn Bairstow và được chỉ đạo bởi đạo diễn tài năng.